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LIVELLO AVANZATO
Lingue del corso italiano/inglese,
materiale del corso in lingua inglese

MODULO 3
Bioinformatica avanzato

5/6 ottobre 2009


Docenti
Prof. Ferdinando Di Cunto, Prof. Mauro Fasano,
Dr. Christian Damasco, Dr. Ugo Ala

SEDE 1
Molecular Biotecnology Center, Università di Torino
via Nizza 52, Torino


DURATA
2 giorni

QUOTA DI ISCRIZIONE
€ 120.00 + IVA 20% (totale € 144,00)

Prerequisiti
Conoscenze di fisica e chimica e biologia molecolare
a livello universitario.
Conoscenza del significato dei principali database biologici.

 

Il sequenziamento del genoma umano, con tutti i relativi sviluppi tecnologici, ha determinato una svolta epocale nella ricerca biologica. Infatti, nel giro di pochissimi anni si è passati da una condizione in cui era fondamentale l’acquisizione di conoscenze sulla struttura e la funzione dei singoli geni e dei loro prodotti ad una situazione in cui questo tipo di informazione non è più considerato limitante.
Le principali banche dati pubbliche contengono oggi una enorme quantità di informazioni sulla struttura e la funzione dei geni di moltissimi organismi. I principali programmi bioinformatici rappresentano uno strumento fondamentale per poter utilizzare efficientemente queste informazioni a fini di ricerca. Questo corso è dedicato soprattutto a coloro che, per scopi di ricerca, debbano utilizzare strumenti di tipo bioinformatico. Il corso si propone di fornire i principi teorici fondamentali per capire il funzionamento dei principali algoritmi, e per poterne sfruttare tutte le potenzialità. Inoltre verrà dato ampio spazio ad esercitazioni pratiche su casi reali. I partecipanti sono incoraggiati a proporre sequenze di loro interesse.

 

Argomenti

  • Valutazione della similitudine tra due sequenze mediante Dot Plot

  • Allineamento globale e locale di coppie di sequenze

  • Principi di funzionamento del programma BLAST

  • Modifica dei principali parametri di BLAST per un utilizzo avanzato

  • matrici di similitudine posizione-specifica (PSSM)

  • PSI-BLAST come strumento per la ricerca di omologia

  • Esercitazioni: definizione di PSSM per una famiglia di proteine

  • Allineamento multiplo: CLUSTALW

  • Modellizzazione di allineamenti multipli: famiglie di domini conservati

  • Predizione di strutture geniche in sequenze genomiche: GeneScan

  • Integrazione tra metodi di allineamento e metodi predittivi nella definizione delle strutture geniche

  • Correlazione sequenza struttura

  • Determinazione sperimentale della struttura proteica. Diffrazione raggi x, NMR

  • Analisi ed interrogazione del Protein Data Bank

  • Metodi predittivi

  • Metodi comparativi (per omologia)

  • Threading/Fold recognition

  • Metodi ab initio

  • Validazione del modello

 

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MODALITA’ DI PARTECIPAZIONE


I moduli DI TUTTI I LIVELLI non hanno propedeuticità, possono essere frequentati in numero variabile a seconda degli interessi e delle necessità di aggiornamento di ciascuno.

Non è prevista selezione, ma per facilitare l’autovalutazione del livello di ingresso da parte dei partecipanti ad ogni modulo sono associati i requisiti minimi consigliati per una partecipazione efficace.

I moduli in presenza sono a numero chiuso, i posti disponibili 20 e vengono assegnati in ordine di iscrizione. Quanti fossero in lista di attesa avranno precedenza sulla partecipazione all’edizione successiva del modulo prescelto, ma ovviamente nessun obbligo.

I moduli non vengono attivati per un numero di iscritti inferiore ai 10.

Ogni modulo teorico è affiancato da esercitazioni pratiche.

L’orario delle lezioni previsto per tutti i moduli in presenza è 10.00-17.00, ma la durata di ciascun modulo varia. Costi di iscrizione e durata sono indicati alla fine del programma di ciascun modulo.

NB. Le date possono subire lievi modifiche in base alla disponibilità dei docenti

Per iscriversi, spedire on-line la registration form disponibile sul sito

Il costo di iscrizione è indicato all'inizio della pagina di ciascun modulo; comprende la partecipazione alle lezioni, il materiale didattico e l'attestato di partecipazione

MODALITA’ DI PAGAMENTO

La quota deve essere versata, dopo aver ricevuto messaggio di conferma da parte della segreteria organizzativa, attraverso bonifico bancario sul conto corrente i cui estremi sono i seguenti:

Fondazione per le Biotecnologie
Istituto Bancario Intesa San Paolo di Torino, Ag. 1
CODICE IBAN: IT81 Q030 6901 0011 0000 0104 365
Causale del versamento: cognome del partecipante e nome del modulo

Con carta di credito cliccando sull'immagine sottostante

   

 

VITTO, ALLOGGIO e TRASPORTI


La segreteria organizzativa provvederà ad inviare un elenco degli hotel consigliati nella zona della sede dei corsi, che è centrale, ben servita con i mezzi pubblici e comoda dalla stazione ferroviaria Porta Nuova di Torino.
Informazioni più dettagliate, con indirizzi, recapiti e piantine, arriveranno via mail ai partecipanti dei corsi.

Per informazioni siete invitati a contattare la segreteria organizzativa ai recapiti in calce.

Elisabetta Lombardini
Fondazione per le Biotecnologie
Villa Gualino
Viale Settimio Severo 63
10133 - TORINO
tel. 011 6600187
fax. 011 6600708
elisabetta.lombardini@fobiotech.org
www.fobiotech.org
www.elearning.fobiotech.org